Carcassonne et le catharisme

Vicomté dépendant du comté de Toulouse, Carcassonne était, au début du XIIIᵉ siècle, la propriété des comtes de Trencavel. Foyer d'hérésie selon les armées du nord et le Pape, mais surtout pierre angulaire du pouvoir en Languedoc, Carcassonne a été un objectif privilégié de la croisade contre les albigeois.

De fait, en 1209, après le sac de Béziers, les croisés font le siège devant Carcassonne. Voulant négocier, le jeune vicomte Raymond Roger Trencavel se rend dans le camps des adversaires. Au mépris des règles de chevalerie, il est fait prisonnier et meurt dans une prison de sa propre cité quelques mois plus tard (le 10 Novembre 1209).

Carcassonne devient est alors une sénéchaussée royale,au profit de roi Louis VIII.

Cependant, dans un dernier sursaut, le pays albigeois se révolte en 1240, suivant Raymond Trencavel, seigneur "faidit".
Ce dernier fera sa soumission au roi Saint-Louis en 1247 et partira en Terre Sainte pour la septième croisade.

De 1240 au XVᵉ siècle, l'inquisition prend place dans la cité, n'utilisant cependant pas la tour improprement nommée "de l'inquisition".